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Zuerst muss Sollte man sicherstellen ob Xdebug installiert ist. Sollte das nicht der Fall sein kann das mit folgendem Befehl nachgeholt werden.

$ sudo apt-get install php5-xdebug

Jetzt muss die Konfigurationsdatei bearbeitet werden.

$ sudo nano /etc/php5/apache2/conf.d/xdebug.ini

Die Datei sollte dann in etwa so aussehen:

zend_extension=/usr/lib/php5/20090626+lfs/xdebug.so
xdebug.remote_enable=1
xdebug.remote_host=localhost
xdebug.remote_port=9000
xdebug.remote_handler=dbgp
xdebug.remote_mode=req
xdebug.idekey=netbeans-xdebug

Natürlich sind das nicht alle Möglichkeiten. Eine Komplette Liste der Einstellungen findet sich in der Dokumentation.

Am Ende den Apachen neu starten und schon kann es losgehen.

$ sudo /etc/init.d/apache2 restart

Weitere Informationen zum Thema:
http://www.xdebug.org/docs/all_settings